Pracovný princíp zariadenia na rozprašovanie magnetrónu je založený na driftovom pohybe elektrónov E × B pod pôsobením elektrických a magnetických polí. Ióny sú generované kolíziou elektrónov a atómov argónov, bombardujúc cieľový materiál, aby spôsobil, že sa naprašuje a ukladá na substráte, aby vytvoril tenký film. Na izoláciu cieľov so zlou vodivosťou je na udržanie procesu rozprašovania potrebné rádiové frekvenčné rozprašovanie (RF).

